Ressourcen
Komplexome
Complexomics.org
Einige unserer hochaufgelösten BN-MS-Komplexome, wie zum Beispiel MitCOM, stellen wir auf unserer Seite Complexomics.org zur Verfügung.
Ein interaktiver Viewer ermöglicht die Anzeige beliebiger Proteinprofile eines Datensatzes und ermöglicht die Suche nach (lokal) ähnlichen Profile mittels einfacher Korrelation.
CEDAR
CEDAR ist eine öffentliche Datenbank für Komplexom-Daten, welches vom Center for Molecular and Biomolecular Informatics am niederländischen Radboud UMC betrieben wird. An der Entstehung des Projekts war unser Institut maßgeblich beteiligt.
Software
Belki
Eine Desktop-Anwendung für die visuelle Analyse multi-dimensionaler Proteomik-Daten.
Belki läuft unter MacOS, Windows, and GNU/Linux und ist freie Software unter der GNU General Public License, Version 3.
https://github.com/phys2/belki
Anwendungen für die Lehre
Simulation einer Spannungsklemme
Simuliert ein elektrophysiologisches Ganz-Zell-Spannnungsklemmen-Experiment (whole-cell voltage-clamp) mit Xenopus laevis oocyten. Damit können physikalische und physiologische Grundlagen des Membranpotentials an Studierende der Medizin und Pharmazie vermittelt werden.
Simulation eines Elektrokardiogramms (EKG)
Simuliert ein Lehr-Experiment, mit dem Studierenden der Medizin und Pharmazie die biophysikalischen Grundlagen des Elektrokardiogramms vermittelt werden können. Hierzu wird ein feuchtes Handtuch als Äquivalent zu Haut und Körper eines Menschen eingesetzt. Elektroden messen das elektrische Potential, welches durch eine kleine Stromquelle (Herz) erzeugt wird, bei unterschiedlichen Winkeln.