Prof. Seifert arbeitet zu Themen der Waldwachstumskunde, hier insbesondere den Einfluss von Stressfaktoren auf das Wachstum von Bäumen, wobei das Betrachtungsspektrum von der Zelle bis zum Bestand reicht und Stress durch die gegenwärtigen Klimaänderungen im Zentrum der Betrachtung sieht. Dabei werden Wachstumsprozesse vor allem in ihrer strukturellen Ausprägung erforscht. Moderne Methoden der Erfassung von Baum und Aststrukturen mittels Laserscanning, Verfahren des Maschinellen Lernens zur dreidimensionalen Bildanalyse, Methoden der Jahrringanalyse, der Xylogenese sowie der Quantitativen Holzanatomie sowie Waldwachstumsmodelle gehören zum Methodenspektrum, das aktiv an der Professur weiterentwickelt wird.
Weitere wichtige Forschungsschwerpunkte sind Agroforstsysteme und dort vor allem die Baumkomponente sowie die Erfassung von Bäumen und Wäldern mit effizienten Verfahren im Zuge der Präzisionsforstwirtschaft und der dendroklimatologischen und dendroarchäologischen Forschung.
